Lyrický román - najväčšie dielo spisovateľa - je napísaný epistolárnou formou. Meno protagonistu - Hyperion - sa vzťahuje na obraz titana, otca boha Slnka Heliosa, ktorého mytologické meno znamená High-Seating. Zdá sa, že akcia románu, ktorý je akýmsi „duchovným odyseam“ hrdinu, sa odohráva mimo času, hoci dejiskom udalostí je Grécko druhej polovice 18. storočia, ktoré je pod tureckým jarmom (o čom svedčia odkazy na povstanie v mori a bitka o Chesme v 1770).

Po súdnych procesoch, ktoré padli na jeho miesto, sa Hyperion odklonil od účasti na boji za nezávislosť Grécka, stratil nádej na bezprostredné oslobodenie svojej vlasti, uznal svoju bezmocnosť v modernom živote. Od tejto chvíle si vybral cestu odlúčenia pre seba. Hyperion, ktorý má príležitosť opäť sa vrátiť do Grécka, sa usadí na Korintskom ostrove, odkiaľ píše listy svojmu kamarátovi Bellarminovi, ktorý žije v Nemecku.

Zdá sa, že Hyperion dosiahol želané, ale kontemplatívne pustovníctvo neprináša spokojnosť, príroda mu už neotvára ruky, vždy túži po zlúčení s ňou, zrazu sa cíti cudzincom, nechápe. Zdá sa, že nie je predurčený na nájdenie harmónie vo svojom vnútri ani mimo neho.

V reakcii na žiadosti Bellarminu mu Hyperion píše o svojom detstve strávenom na ostrove Tinos, o snoch a nádejiach toho času. Odhaľuje vnútorný svet bohato nadaného tínedžera, ktorý je nezvyčajne citlivý na krásu a poéziu.

Na formovanie názorov mladého muža má obrovský vplyv jeho učiteľ Adamas. Hyperion žije v dňoch trpkého úpadku a národného zotročenia svojej krajiny. Adamas vnáša žiakovi obdiv k starovekej ére, navštevuje majestátne zrúcaniny bývalej slávy, hovorí o odvahe a múdrosti veľkých predkov. Hyperion prežíva ťažký rozchod so svojím milovaným mentorom.

Hyperion, ktorý je plný duchovnej sily a vysokých impulzov, odchádza na Smyrnu, aby študoval vojenské záležitosti a navigáciu. Je povznesený, túžiaci po kráse a spravodlivosti, neustále sa stretáva s ľudskou dvojitou tvárou a zúri. Skutočným úspechom je stretnutie s Alabandou, na ktorom nájde blízkeho priateľa. Mladí muži sa radujú z mladosti, dúfajú v budúcnosť, spája ich vysoká myšlienka oslobodenia vlasti, pretože žijú v chudobnej krajine a nemôžu sa s tým zmieriť. Ich názory a záujmy sú do značnej miery blízke, nemajú v úmysle byť ako otroci, ktorí sa zvyčajne oddávajú sladkej facke, sú ohromení túžbou po čine. Tu sa zistí rozpor. Alabanda - muž praktických akcií a hrdinských impulzov - neustále sleduje myšlienku potreby „vyhodiť do vzduchu zhnité pahýly“. Hyperion však trvá na tom, že je potrebné ľudí vzdelávať v znamení „teokracie krásy“. Alabanda takéto argumenty nazýva prázdnymi fantáziami, priateľmi hádkami a ich časťami.

Hyperion prežíva ďalšiu krízu, vracia sa domov, ale svet okolo neho je bielený, odchádza do Calavria, kde ho opäť prebudí komunikácia s krásami stredomorskej prírody.

Notarova priateľka ho privádza do toho istého domu, kde stretáva svoju lásku. Diomita sa mu zdá božsky krásna, v nej vidí neobvykle harmonickú povahu. Láska spája ich duše. Dievča je presvedčené o vysokej povolaní svojho vyvoleného - byť „vychovávateľkou ľudí“ a viesť boj vlastencov. Diomita je napriek tomu proti násiliu, dokonca aj proti vytvoreniu slobodného štátu. Hyperion si užíva šťastie, ktoré k nemu prišlo, získal pokoj, ale očakáva tragické rozčarovanie idyly.

Dostal list od Alabandy so správou o nadchádzajúcom príhovore gréckych patriotov. Po rozlúčení so svojím milencom sa Hyperion ponáhľa pripojiť k radom bojovníkov za oslobodenie Grécka. Je plný nádeje na víťazstvo, ale je porazený. Dôvodom nie je len impotencia pred vojenskou silou Turkov, ale aj nesúlad s ostatnými, stret ideálu s každodennou realitou: Hyperion cíti nemožnosť výsadby raja pomocou skupiny lupičov - vojaci oslobodzovacej armády vykonávajú lúpeže a masakry a nič sa nemôže obmedziť.

Keď sa rozhodol, že so svojimi krajanmi nemá nič spoločné, vstúpi do služby v ruskej flotile. Odteraz na neho čaká osud vyhnanstva, ktorý ho preklínal aj jeho otec. Frustrovaný, morálne postihnutý, hľadá smrť v bitke pri Chesme, ale zostáva nažive.

Po rezignácii má v úmysle konečne pokojne liečiť Diomitu niekde v Alpách alebo Pyrenejach, ale dostáva správy o jej smrti a zostáva neznesiteľným.

Po mnohých putovaniach končí Hyperion v Nemecku, kde už nejaký čas žije. Zdá sa mu však, že tam prevládajúca reakcia a zaostalosť udierajú. V liste adresujúcemu kamarátovi hovorí opatrne o nepravdivosti umierajúceho verejného poriadku, o nedostatku nemeckých občianskych pocitov, malichernosti túžob, o zmierení s realitou.

Keď učiteľ Adamas predpovedal Hyperionovi, že také povahy ako on sú odsúdené na samotu, putovanie, večnú nespokojnosť so sebou samými.

A Grécko je porazené. Diomita je mŕtvy. Hyperion žije v chatrči na ostrove Salamis, triediac spomienky na minulosť, smútiaci po stratách, nerealizovateľnosti ideálov, snaží sa prekonať vnútorné rozpory a pociťovať trpký pocit melanchólie. Zdá sa mu, že splatil čiernu nevďačnosť matky zeme, zanedbávajúc jeho život a všetky dary lásky, ktoré premrhala. Jeho osudom je kontemplácia a filozofovanie, ako predtým zostáva verný panteistickej myšlienke vzťahu človeka a prírody.