Darlingova rodina má tri deti z počasia. Najstarší je Wendy, potom príde John a potom Michael. Majú neobvyklú chůvu - veľký čierny potápačský pes menom Nena. Jedného večera, keď išla do spálne s deťmi už v posteli, pani Darlingová vidí chlapca, ktorý letí do okna a za ním - zvláštny svetelný bod. Kričí prekvapene, Nan beží kričať. Chlapcovi sa podarí vyletieť z okna, ale v Nichiných zuboch zostáva jeho tieň! Pani Darlingová to zvinie a vloží do komody.
O pár dní neskôr sa chystajú navštíviť pani a Darling. V zhone sa pán Darling zrazí s Nenou a na nohaviciach - to je problém! - srsť zostáva. Darling kope Nanu na dvor a položí ju na retiazku. Akonáhle rodičia opustia dom, malé deti letí s deťmi - toto je víla Tinker Bell, hľadá tieň. Po nej sa objaví Peter Pan. Pri znamení Tinker Bell (víla nevie hovoriť, vydáva melódiové zvonenie) Peter nájde tieň a pokúsi sa ho pripevniť späť, ale nič nevyjde. Peter začne plakať a jeho vzlyky sa prebudia Wendy. Keď sa Wendy dozvedela, čo sa deje, šije na Petrových pätách tieň. Trochu to bolí, ale on trpí. Cítiac dôveru vo Wendy, Peter jej hovorí o sebe: utiekol z domu a rozhodol sa, že nikdy nebude dospelým.Žije na ostrove Netinebud so stratenými chlapcami („keď dieťa vypadne z kočíka, pôjde do krajiny Netinebud“). Zároveň sa o víly niečo deje: ukázalo sa, že víly sa rodia z detského smiechu a každé dieťa má svoju vílu. Len čo si niekto pomyslí „hlúpe, na svete nie sú žiadne víly“ - a víly zomrú.
Keď sa dozvie, že Wendy vie rozprávať príbehy, Peter zavolá Wendy na ostrov („Naučím vás lietať a budeme spolu lietať“), aby rozprávala rozprávky a je matkou všetkých stratených chlapcov. Wendy zaváha, ale stále súhlasí. John a Michael s ňou lietajú.
Obyvatelia ostrova sa pripravujú na stretnutie s Petrom. Chlapci hľadajú miesto, kde Peter pristane. Piráti, ktorých vedie kapitán Jez Hook, hľadajú chlapcov, redskiny (ich vodca je Veľký Malý Panter) hľadajú pirátov a divoké zvieratá hľadajú redskiny, aby ich zjedli.
Aby sa zabránilo príchodu Wendy, objaví sa víla Tinker Bell. (Zo závisti!) V mene Petra prikazuje chlapcom, aby strieľali Wendy s lukom. Nemajú dôvod pochybovať a jeden z nich strieľa. Wendy padá na zem a leží mŕtvy. Ale nezomrela, zachránila ju žalúdo, ktoré mu viselo okolo krku, darček od Petra Pana a prepichla ho šípka. Ale Wendy je veľmi slabá a všetci chlapci, ktorých vedie blížiaci sa Peter, postavili jej dom a postavili ho okolo nej. Dom sa ukazuje celkom dobre. Wendy sa vážne angažuje vo svojich povinnostiach: varí, vymazáva, sakramentsky a samozrejme rozpráva rozprávky.
Piráti nenechávajú chlapcov samých. Kapitán Hook - jeho meno je od tej doby, keď Peter odrezal ruku, namiesto ktorej musel opraviť železný háčik - Peter to nemôže odpustiť, najmä preto, že krokodíl prehltol ruku natoľko, že sa mu páčilo lovecké háčiky Je dobré, že to môžete počuť tikaním kapitánových náramkových hodiniek, ktoré neprestali chodiť v krokodílovom bruchu. Kapitán prichádza s myšlienkou upiecť otrávený koláč, aby chlapci zomreli, ale nedokáže to dosiahnuť týmto spôsobom - Wendy im nedovolí jesť sladkosti a koláč zostane bezpečne na lúke, kým nad ním v tme neklesne kapitán a nepadne na zem. Jedného dňa chcú piráti priviazať indickú princeznú Tiger Lily ku skale v lagúne, aby ju zaplavili prílivom. Peter Pan dokáže oklamať pirátov tým, že im nariadi (hlasom kapitána Hooka) prepustiť ju. Potom Peter musí bojovať s Hookom a on ho zraní. Peter zachraňuje vtáka.
Jedného večera Wendy povie chlapcom ich obľúbenú rozprávku - o tom, ako žil jeden pán a jedna dáma, kde jedného dňa deti odleteli na ostrov Netinebud. A ako vždy nechávali okno otvorené, aby deti mohli lietať domov.
Peter namieta proti Wendy: predtým premýšľal aj o matkách, a tak sa nijako neponáhľal vrátiť. A keď prišiel, okno bolo zatvorené a ďalší chlapec spal vo svojej posteli.
Potom si John a Michael, bratia Wendy, uvedomia, že sa musia ponáhľať domov.Wendy tiež vyzýva ostatných chlapcov, ktorí sú presvedčení, že ich rodičia ich určite adoptujú. Každý súhlasí, s výnimkou Petra Pana, ktorý sa nechce stať veľkým. Peter žiada Indov, aby videli Wendy a chlapcov, ale piráti opäť zasiahli. Dokážu poraziť Indov nečestným spôsobom a zajať Wendy a chlapcov. Peter sa o tom dozvie od Tinkera Bell a ponáhľa sa k záchrane. Medzi Peterom Panom a kapitánom Hookom je rozhodujúci boj. Piráti sú porazení. Chlapci a Wendy odlietajú domov.
Medzitým v Londýne pani a Darling naďalej čakajú na deti a nikdy nezatvárajú škôlku. A pán Darling sa nemôže odpustiť, že nevykopol Nanu z toho strašného večera z domu a postavil ju na retiazku. Preto sľúbil, až kým sa deti nevrátia do bývania v búdke, bol v nej vzatý do práce a priniesol domov z práce. Pani Darling sa posadí na klavír a začne hrať. V túto chvíľu dorazí Peter a Tinker Bell. Zatvoria okno tak, aby sa Wendy rozhodla, že mama už na ňu nebude čakať a nemiluje ju, a vrátili by sa s Petrom na ostrov. Zvuk hudby je však veľmi smutný a Peter otvorí okno znova. Wendy, John a Michael lietajú v okne a stúpajú na svoje postele. Matka ich objavuje, volá po svojom otcovi a Nana tiež vchádza do miestnosti. Každý je šťastný. A chlapci čakajú dole, zatiaľ čo Wendy o nich hovorí svojim rodičom. Keď ich bolo päť tisíc, vstúpili do domu a postavili sa pred pani Darlingovú. Pani aj Darling sa samozrejme rozhodli ich prijať! Peter znova letí na ostrov. Sľubuje Wendy, že bude lietať budúci rok, ale na to zabudne.A keď sa Peter znovu objaví, Wendy je už vydatá a má malú dcéru Jane.
Peter si nevšimol zmeny a zavolal s ním Wendy, ale s povzdychom odmietla, pretože už je dospelá. Wendy opustí miestnosť, aby sa upokojila, a Peter Pan sedí na podlahe a plače. Jeho vzlyky prebudia Jane.
A všetko sa opakuje znova.
Keď Jane dorastie, narodí sa jej dcéra Margaret a teraz Margaret letí s Petrom Panom na ostrov Netinebud ... A to bude pokračovať, až kým deti prestanú byť tak veselé, nepochopiteľné a bezcitné.
