„Príbeh ...“ začína modlitbou Innocenta, autora diela, ktorý žiada Pána, aby mu pomohol pri jeho práci. Toto je tradičná technika používaná v každodennej literatúre. Potom začína samotný príbeh, ktorý sa vedie v prvej osobe. Vo štvrtok, tretí týždeň po Veľkej noci, pozýva starší Paphnutius mnícha Innocent, aby šiel s ním do kláštora. Keď Paphnutius a jeho učeník prišli k rybníku a priblížili sa k miestu za priehradou, videli cez ňu pretekajúci prúd. Starší nevinne poučí, ako blokovať cestu vody. Študent sa čuduje, prečo to starší hovorí teraz - takže príde pracovať s bratmi a starší ich povedie. Paphnutius na to odpovedá, že má dôležitejšiu záležitosť.
Po službe šiestej hodiny zavolá Paphnutius mnícha do svojej cely. Keď vstúpi, vidí vo všetkých svojich šatách Paphnutius v posteli. Blahoslavený hovorí učeníkovi, že „puto sa musí vyriešiť“. Innocent nerozumie jeho slovám, zmocneným strachom z toho, že nič nehovorí a podriaďuje sa Paphnutiusovi - chodí pracovať na priehrade, kam ho poslal opát. Ale ani nevinný, ani ostatní mnísi nemôžu pracovať kvôli „zmätku“ v dušiach.
Po návrate do kláštora mnísi našli vo svojej cele Paphnutia.Žiada čo najskôr, aby poslal kniežaťa Michailu, a žiada ho, aby už sám knieža nemal chodiť do kláštora a nikoho neposlal na Pafnutius, pretože „sadol si“ s „inými záujmami“. Vo večerných hodinách nie je opát prítomný v bohoslužbách v kostole a odpovedá na zmätené otázky mníchov, že v ten istý deň v týždni, vo štvrtok, sa zbaví svojej slabosti. Autor teda ukazuje, že blahoslavený Pafnutius už vopred pozná čas svojej smrti. Nepochopenie mníchov bolo zámerne zveličené v príbehu, aby sa zdôraznil dar predvídania svätého, ktorý nebol daný bežným ľuďom.
Paphnutius znovu počúva rannú službu vo svojej cele, potom zavolá všetkých bratov a ospravedlňuje sa im. Zároveň odmieta požehnať remeselníkovi Dionýziovi, ktorý bol v tom čase v kláštore náhodou, a vysvetlil, že si nemôže pomôcť. Opát prepustil bratov (celkom bolo v kláštore deväťdesiatpäť ľudí, ako poznamenáva Innocent) a Innocent žiada, aby s ním zostali neustále. Študent podrobne popisuje, aké služby Paphnutius vykonával. Môžeme teda skutočne predpokladať, že "Príbeh ..." bol napísaný na základe skutočných denníkov, pretože mnísi počítali denný čas podľa bohoslužieb.
Medzitým princ Michail pošle, aby zistil, prečo Paphnutius nenariadil nikomu prijatie, na čo starší odpovedá: „Nemá so mnou nič spoločné.“ Opat tiež neprijíma listy a peniaze z dedičstva Tveru a je nahnevaný, keď sa ich Innokenty snaží všetky nechať rovnaké.Autor vždy zdôrazňuje, že starší Pafnutius sa vzdáva všetkých pozemských vecí a duchovne sa začína pripravovať na smrť, keď tomu nikto z jeho okolia stále nechápe. Niektoré vlastnosti, ktoré nevinné noty v správaní opata poznajú iné, sú však priťažujúce (napríklad nechať si ujsť jediný verš alebo slová vo verši), iné sú nezvyčajné (umožňuje vám osvetľovať lampu v cele po Vesperovi, hoci sa zvyčajne modlil po službe v tme) , volá pred kňazom pred sviatosťou, hoci predtým nikomu v takej situácii nikdy nehovoril o najnaliehavejších veciach).
Opisuje sa v „Príbehu ...“ a vo vzťahoch so svetskými autoritami. Napriek tomu, že Paphnutius nechce prijímať vyslancov princa Michaela, dokonca ani kňaza, svojimi činmi prejavuje nielen svoje vlastné odcudzenie od sveta, ale aj nesprávnosť kniežaťa, pretože žiada požehnanie iba pre seba a jedného syna. "Nie je princ Vasily syn?" Sám vo svojej rodine spôsobuje nezhody, “hovorí starší Paphnutius. Pop Ivan, princov posol, sa stále snaží dosiahnuť svoj cieľ a získať požehnanie. Chodí do kostola a dúfa, že sa tam počas služby stretne s opátom. Keď si to Paphnutius všimol, rýchlo prešiel k oltáru. Až potom, ako kňaz opustí kláštor, opustí Paphnutius kostol a vráti sa do svojej cely.
Paphnutius tiež odpovedá na žiadosti iných kniežat - veľkovojvodu Ivana Vasilieviča, veľkovojvodkyne Márie, veľkovojvodkyne Sophie v Grécku, odmietajúcich prijímať listy, dary a poslov.
Na otázku Innocenta, aký bude jeho zákon o kláštornej štruktúre, odpovie Paphnutius zdĺhavým rozhovorom a po abcházii nehovorí o nástupcovi a hovorí, že kláštor zveril Najsvätejšiemu. Nevinný poznamenáva, že opát nikdy kláštor nenazval svojím vlastným, ale najsvätejším a povedal: „Vytvorila ho.“ Hneď pred smrťou predpovedá Paphnutius povstanie medzi bratmi. V súvislosti s jeho predchádzajúcimi slovami je možné nejakým spôsobom pochopiť, že starý muž nemal blízkeho študenta, ktorého by chcel vidieť ako opata, a preto zvažoval možné nezhody medzi bratmi v tejto veci. V budúcnosti sa v živote Jozefa z Volotska bude hovoriť, že sv. Paphnutius odkázal svoj kláštor Josephovi, ktorý bol jeho najbližším učeníkom.
Smrť svätca je opísaná jednoducho a zároveň dojímavo: „A duša odletela od starého muža, pretože zaspal večným spánkom, roztiahol nohy a prekrížil ruky, pripojil sa k svätým otcom, ktorých život napodobňoval.“
